Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lipo1J3QME6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lipo1J3QME6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms