Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm21863J3KMP8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21863J3KMP8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms