Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Taf4bG5E8Z2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Taf4bG5E8Z2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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