Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfip1G5E8V9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfip1G5E8V9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms