Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcf11G3X9Z4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcf11G3X9Z4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcf11G3X9Z4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms