Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6482F6YHC1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6482F6YHC1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms