Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29094F6Q785 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm29094F6Q785 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms