Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms