Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmod3E9QA62 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms