Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc141E9Q8Q6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc141E9Q8Q6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms