Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col22a1E9Q7P1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col22a1E9Q7P1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms