Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BC005561E9Q5E2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BC005561E9Q5E2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms