Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms