Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930523C07RikE9Q2T4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930523C07RikE9Q2T4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms