Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt78E9Q0F0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms