Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430403G16RikD3Z5L4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430403G16RikD3Z5L4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms