Protein–RNA interactions for Protein: D3Z536

Gm8225, Predicted gene 8225, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8225D3Z536 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8225D3Z536 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8225D3Z536 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms