Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap70D3YVL2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap70D3YVL2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap70D3YVL2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap70D3YVL2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap70D3YVL2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap70D3YVL2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap70D3YVL2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap70D3YVL2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms