Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc13D3YV10 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms