Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cttnbp2B9EJA2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Cttnbp2B9EJA2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cttnbp2B9EJA2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms