Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm6133B2RY53 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm6133B2RY53 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms