Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AU015836B2RUM3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AU015836B2RUM3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms