Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms