Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrn3B2RS91 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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