Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CadB2RQC6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CadB2RQC6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms