Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Brpf3B2KF05 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brpf3B2KF05 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms