Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms