Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms