Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M5A7VMS3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M5A7VMS3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms