Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms