Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Herc3A6H6S0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc3A6H6S0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms