Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms