Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef17A2ASJ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef17A2ASJ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms