Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FocadA2AKG8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FocadA2AKG8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FocadA2AKG8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms