Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ambra1A2AH22 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms