Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm884A2A9H6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm884A2A9H6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms