Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm16A2A935 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm16A2A935 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms