Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm2A2A7B5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm2A2A7B5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms