Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms