Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms