Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac5Q9Z2V6 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hdac5Q9Z2V6 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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