Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf4Q9QZS2 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rnf4Q9QZS2 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rnf4Q9QZS2 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rnf4Q9QZS2 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf4Q9QZS2 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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