Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms