Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc47Q9D024 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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