Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf144aQ925F3 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf144aQ925F3 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf144aQ925F3 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf144aQ925F3 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Rnf144aQ925F3 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rnf144aQ925F3 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms