Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms