Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Actn1Q7TPR4 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms