Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Hoxa13Q62424 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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Hoxa13Q62424 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxa13Q62424 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms