Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tff3Q62395 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Tff3Q62395 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.3 ms