Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Olfr518-201ENSMUST00000059617 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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